久久综合一区二区三区|国产精品免费视频播放|91免费看日韩一区二区|亚洲一二三四区无码在线∴|无码人妻一区二区三区av|99久久高清精品免费观看|色综合久久综合一区二区三区|国产AV综合A∨一区二区三区

近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所李付廣研究員團(tuán)隊利用基于參考基因組的轉(zhuǎn)錄組從頭組裝技術(shù)和核糖體圖譜分析技術(shù)，對棉花基因組注釋進(jìn)行了更新，揭示了控制棉花纖維發(fā)育轉(zhuǎn)錄后調(diào)控新機(jī)制，對棉花纖維品質(zhì)的遺傳改良具有指導(dǎo)意義。相關(guān)研究成果以“Transcriptional and translational landscape fine-tune genome annotation and explores translation control in cotton”為題在線發(fā)表在國際著名綜合性期刊《尖端研究雜志（Journal of Advanced Research）》（IF=12.823）上。

棉花是一種重要的天然纖維作物，是研究細(xì)胞伸長和多倍體化的理想材料。高通量技術(shù)如轉(zhuǎn)錄組從頭組裝和核糖體圖譜分析技術(shù)可用于分析轉(zhuǎn)錄組和翻譯組，鑒定已翻譯的開放閱讀框的數(shù)量，并且已在擬南芥、玉米和番茄中廣泛應(yīng)用。盡管目前在棉花全基因組學(xué)和泛基因組學(xué)中取得了一系列進(jìn)展，但基因間注釋的缺失制約了棉花遺傳改良的進(jìn)一步發(fā)展，而且在棉纖維生長的不同階段，轉(zhuǎn)錄后調(diào)控對棉纖維發(fā)育的影響仍不清楚。

該研究利用轉(zhuǎn)錄組和翻譯組聯(lián)合分析的手段，對陸地棉中棉所24（ZM24） 8種不同組織進(jìn)行研究。鑒定到1589個小開放閱讀框（sORF），其中包括1376個上游開放閱讀框（uORF）、213個下游開放閱讀框（dORF）。以及552個具有潛在編碼功能的長鏈非編碼RNA（lncRNA）。此外，利用多組學(xué)聯(lián)合分析方法，對正常纖維品種ZM24和短纖維品種 pag  1 突變體纖維組織進(jìn)行研究，鑒定到一系列在纖維中特異表達(dá)的sORF相關(guān)基因，其中包括超長鏈脂肪酸合成途徑限速酶基因 Gh  KCS6 。因此，為進(jìn)一步驗證 Gh  KCS6 在棉纖維發(fā)育中的功能，研究團(tuán)隊創(chuàng)制了 Gh  KCS6 過表達(dá)和RNAi沉默棉花材料。發(fā)現(xiàn) Gh  KCS6 的過表達(dá)促進(jìn)了棉纖維伸長，而沉默 Gh  KCS6 后纖維長度變短，表明 Gh  KCS6 正向調(diào)控棉纖維伸長。該研究對棉花基因組注釋進(jìn)行了更新，并為棉花纖維發(fā)育轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制提供了新的見解。

中棉所李付廣研究員和楊作仁研究員為該論文共同通訊作者，鄭州大學(xué)農(nóng)學(xué)院博士后Ghulam Qanmber、揚州大學(xué)農(nóng)學(xué)院尤琪講師和中棉所楊召恩研究員為該論文共同第一作者。該研究得到國家重點研發(fā)計劃（2022YFF1001400）、國家自然科學(xué)基金（32000458）、天山英才計劃（2022TSYCCX0087）和新疆重點研發(fā)計劃（2022B02052）的資助。

原文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.jare.2023.05.004

圖1：轉(zhuǎn)錄組和翻譯組聯(lián)合分析揭示棉纖維發(fā)育轉(zhuǎn)錄后調(diào)控潛在機(jī)制